Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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LONRF1Q17RB8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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LONRF1Q17RB8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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LONRF1Q17RB8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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LONRF1Q17RB8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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