Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCK2Q16822 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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