Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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