Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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NRF1Q16656 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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NRF1Q16656 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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NRF1Q16656 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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NRF1Q16656 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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NRF1Q16656 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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NRF1Q16656 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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