Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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