Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms