Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA6Q15825 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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