Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms