Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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