Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIP4Q15650 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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