Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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