Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF1Q15361 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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