Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms