Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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