Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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