Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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