Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GINS1Q14691 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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