Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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