Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPSQ13938 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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