Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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