Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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