Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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NAE1Q13564 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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