Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
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