Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEUROD1Q13562 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
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