Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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