Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B2Q13435 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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