Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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ERCC8Q13216 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERCC8Q13216 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ERCC8Q13216 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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