Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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