Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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