Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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CHAF1BQ13112 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHAF1BQ13112 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHAF1BQ13112 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CHAF1BQ13112 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1BQ13112 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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