Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPP2Q13103 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPP2Q13103 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms