Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK2Q13002 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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