Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3Q12983 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3Q12983 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3Q12983 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3Q12983 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3Q12983 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3Q12983 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3Q12983 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3Q12983 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3Q12983 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3Q12983 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP3Q12983 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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