Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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