Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
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