Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC20Q12834 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC20Q12834 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms