Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 SFG1YOR315W 1041 nt3.7□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 SUR1YPL057C 1149 nt3.7□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 TAZ1YPR140W 1146 nt3.7□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 GPI1YGR216C 1830 nt3.7□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 PHO5YBR093C 1404 nt3.7□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 FUN12YAL035W 3009 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 MAL12YGR292W 1755 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 MAL32YBR299W 1755 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 TRS120YDR407C 3870 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 BCS1YDR375C 1371 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 NUF2YOL069W 1356 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YDL032WYDL032W 312 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 AI3Q0060 1248 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 HTD2YHR067W 843 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 IRC18YJL037W 675 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 ERG20YJL167W 1059 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 GPN3YLR243W 819 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 RFC3YNL290W 1023 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 IRC13YOR235W 315 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 PLP2YOR281C 861 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 ATG5YPL149W 885 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 DIB1YPR082C 432 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 ACK1YDL203C 1872 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 SAD1YFR005C 1347 nt3.69□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 PDS1YDR113C 1122 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YDR193WYDR193W 399 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 ERJ5YFR041C 888 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YIR014WYIR014W 729 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 BOS1YLR078C 735 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YPT7YML001W 627 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 SPC2YML055W 537 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 ATG34YOL083W 1239 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YOR082CYOR082C 342 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 snR189snR189 189 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YPR078CYPR078C 1119 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YPR136CYPR136C 513 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 RNR1YER070W 2667 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 DSS1YMR287C 2910 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 ARO1YDR127W 4767 nt3.68□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 MSS4YDR208W 2340 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YJR061WYJR061W 2808 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 FAD1YDL045C 921 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 CBS2YDR197W 1170 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 TLG1YDR468C 675 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 IZH1YDR492W 951 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 COX2Q0250 756 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 IRC9YJL142C 393 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 FIP1YJR093C 984 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 ENT3YJR125C 1227 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YKL162CYKL162C 1209 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 HNT3YOR258W 654 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 CET1YPL228W 1650 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 BUD27YFL023W 2391 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 PMT6YGR199W 2280 nt3.67□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YTM1YOR272W 1383 nt3.66□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 PHM6YDR281C 315 nt3.66□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 SPT15YER148W 723 nt3.66□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 SEC53YFL045C 765 nt3.66□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 RPL22AYLR061W 366 nt3.66□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YLR156WYLR156W 345 nt3.66□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YLR159WYLR159W 345 nt3.66□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 YLR161WYLR161W 345 nt3.66□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 APE2YKL157W 2859 nt3.66□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 SIN4YNL236W 2925 nt3.66□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 ISM1YPL040C 3009 nt3.65□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 SLM2YNL047C 1971 nt3.65□□□□□ -1.82
CTF3Q12748 IPP1YBR011C 864 nt3.65□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 SYC1YOR179C 567 nt3.65□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YBR137WYBR137W 540 nt3.65□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 ICS2YBR157C 768 nt3.65□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 ARO4YBR249C 1113 nt3.65□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RSC1YGR056W 2787 nt3.65□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 SHQ1YIL104C 1524 nt3.65□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 MNL1YHR204W 2391 nt3.65□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 QRI7YDL104C 1224 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RPS13YDR064W 456 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YDR340WYDR340W 303 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YDR509WYDR509W 348 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YGR111WYGR111W 1203 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RTA1YGR213C 954 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 ECM4YKR076W 1113 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 HUT1YPL244C 1020 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YPR027CYPR027C 834 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RIB5YBR256C 717 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 MRPL27YBR282W 441 nt3.64□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 SEC6YIL068C 2418 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 NTH1YDR001C 2256 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 PPZ1YML016C 2079 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 RPO31YOR116C 4383 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 PAU10YDR542W 363 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YFR057WYFR057W 456 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 YGL074CYGL074C 327 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 KXD1YGL079W 657 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 PAU11YGL261C 363 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 AML1YGR001C 747 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 PAU13YHL046C 363 nt3.63□□□□□ -1.83
CTF3Q12748 REH1YLR387C 1299 nt3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms