Protein–RNA interactions for Protein: Q12507

SFG1, Superficial pseudohyphal growth protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFG1Q12507 SUC2YIL162W 1599 nt3.32□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 YML096WYML096W 1578 nt3.32□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 ARG2YJL071W 1725 nt3.32□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 LRG1YDL240W 3054 nt3.32□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 TAF1YGR274C 3201 nt3.32□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 SKN7YHR206W 1869 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 SSU1YPL092W 1377 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 MGT1YDL200C 567 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 CAP2YIL034C 864 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 CDC8YJR057W 651 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 BUR2YLR226W 1188 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 YLR290CYLR290C 834 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 GLO1YML004C 981 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 SHH3YMR118C 591 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 INN1YNL152W 1230 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 RDS1YCR106W 2499 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 PIN4YBL051C 2007 nt3.31□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 HRD1YOL013C 1656 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 ROD1YOR018W 2514 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 RTT109YLL002W 1311 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 YDR149CYDR149C 708 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 YGR190CYGR190C 366 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 FOL2YGR267C 732 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 DOG1YHR044C 741 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 DCG1YIR030C 735 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 GTT1YIR038C 705 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 SAW1YAL027W 786 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 EMC2YJR088C 879 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 SOD1YJR104C 465 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 RIM11YMR139W 1113 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 snR11snR11 258 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 YBR089WYBR089W 600 nt3.3□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 PKP2YGL059W 1476 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 SMC3YJL074C 3693 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 CDC45YLR103C 1953 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 YLR352WYLR352W 2424 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 ARC19YKL013C 516 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 YNL171CYNL171C 369 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 DUG3YNL191W 1074 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 TRM112YNR046W 408 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 TDA1YMR291W 1761 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 MRH4YGL064C 1686 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 VPS17YOR132W 1656 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 MON1YGL124C 1935 nt3.29□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 SEC27YGL137W 2670 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 RRP14YKL082C 1305 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 GPP2YER062C 753 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 MTM1YGR257C 1101 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 YLR416CYLR416C 399 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 URA4YLR420W 1095 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 ATG16YMR159C 453 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 OCA2YNL056W 594 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 RAS1YOR101W 930 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 DGA1YOR245C 1257 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 YPL035CYPL035C 348 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 CHK1YBR274W 1584 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 XRN1YGL173C 4587 nt3.28□□□□□ -1.88
SFG1Q12507 STE24YJR117W 1362 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 HEF3YNL014W 3135 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 RDS2YPL133C 1341 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 JEN1YKL217W 1851 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 FAP7YDL166C 594 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 DET1YDR051C 1005 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 RPS8BYER102W 603 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 YFL065CYFL065C 309 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 TAN1YGL232W 870 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 YGR064WYGR064W 369 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 YIL024CYIL024C 570 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 RPS8AYBL072C 603 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 YOL118CYOL118C 309 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 HHF1YBR009C 312 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 YOR238WYOR238W 912 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 RPN8YOR261C 1017 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 TFB2YPL122C 1542 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 PEX1YKL197C 3132 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 RRP5YMR229C 5190 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 MSD1YPL104W 1977 nt3.27□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 SST2YLR452C 2097 nt3.26□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 KRI1YNL308C 1776 nt3.26□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 VPS53YJL029C 2469 nt3.26□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 WHI3YNL197C 1986 nt3.26□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 MPC1YGL080W 393 nt3.26□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 LIF1YGL090W 1266 nt3.26□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 RPS25AYGR027C 327 nt3.26□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 YGR114CYGR114C 390 nt3.26□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 YKL162CYKL162C 1209 nt3.26□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 THR4YCR053W 1545 nt3.25□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 ARI1YGL157W 1044 nt3.25□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 PPE1YHR075C 1203 nt3.25□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 SDS3YIL084C 984 nt3.25□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.25□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 SNX4YJL036W 1272 nt3.25□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 YJR071WYJR071W 369 nt3.25□□□□□ -1.89
SFG1Q12507 BAG7YOR134W 1230 nt3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.8 ms