Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 AAD16YFL057C 459 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YGL039WYGL039W 1047 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 ARC1YGL105W 1131 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YGR228WYGR228W 345 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 SOL4YGR248W 768 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 SPC1YJR010C-A 285 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 BNA1YJR025C 534 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 GLO1YML004C 981 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 ADI1YMR009W 540 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 SPG4YMR107W 348 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 ROG3YFR022W 2202 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 MSL5YLR116W 1431 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YCR013CYCR013C 648 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 MDH3YDL078C 1032 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 GCS1YDL226C 1059 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YER034WYER034W 558 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 RTT105YER104W 627 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 POR2YIL114C 846 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 UBA1YKL210W 3075 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 AIM29YKR074W 468 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YPR050CYPR050C 414 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 CMD1YBR109C 444 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 PGS1YCL004W 1566 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 snR54snR54 86 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 BUD7YOR299W 2241 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 MPP10YJR002W 1782 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 MRK1YDL079C 1506 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 AEP1YMR064W 1557 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 BRF1YGR246C 1791 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YER175W-AYER175W-A 165 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YGR073CYGR073C 372 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YJL119CYJL119C 324 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 MOG1YJR074W 657 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YKL066WYKL066W 444 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 TPK3YKL166C 1197 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 KTR2YKR061W 1278 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 JLP2YMR132C 627 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YMR315WYMR315W 1050 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 ASI2YNL159C 870 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 INA17YPL099C 549 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 MET7YOR241W 1647 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 ARB1YER036C 1833 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 BIK1YCL029C 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YER076CYER076C 909 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YHL049CYHL049C 816 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YKL151CYKL151C 1014 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 COX17YLL009C 210 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 RNH203YLR154C 333 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 CTK3YML112W 891 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 MCM1YMR043W 861 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 RPS19AYOL121C 435 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 MRM1YOR201C 1239 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 snR24snR24 89 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 NAM9YNL137C 1461 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 SHE10YGL228W 1734 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 GEM1YAL048C 1989 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YFL034WYFL034W 3222 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 SET5YHR207C 1581 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 HAP1YLR256W 4509 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 SSL1YLR005W 1386 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 DED81YHR019C 1665 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 CDC5YMR001C 2118 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 RXT3YDL076C 885 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YDL152WYDL152W 366 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 SLO1YER180C-A 258 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 COQ5YML110C 924 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 PGA3YML125C 939 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 TRM112YNR046W 408 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 SPN1YPR133C 1233 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 CDC4YFL009W 2340 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 PIG2YIL045W 1617 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 TRM12YML005W 1389 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 RKM3YBR030W 1659 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 SEN54YPL083C 1404 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 MCP2YLR253W 1710 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 DAK1YML070W 1755 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 DFM1YDR411C 1026 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 RTS3YGR161C 792 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YHL037CYHL037C 402 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YHR097CYHR097C 1101 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 CFD1YIL003W 882 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 VPS1YKR001C 2115 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 PDR17YNL264C 1053 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 HSP82YPL240C 2130 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 UBC4YBR082C 447 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YPR195CYPR195C 330 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 BIT2YBR270C 1638 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 QDR1YIL120W 1692 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 TSL1YML100W 3297 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 ERG5YMR015C 1617 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 snR65snR65 100 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YEL057CYEL057C 702 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 FRA2YGL220W 363 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 YGR017WYGR017W 894 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 RPL8AYHL033C 771 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-NL1Q12391 RPL13BYMR142C 600 nt4.88□□□□□ -1.63
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