Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM2AQ08AH3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM2AQ08AH3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM2AQ08AH3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM2AQ08AH3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM2AQ08AH3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM2AQ08AH3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM2AQ08AH3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms