Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	NHP10	YDL002C	612 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tC(GCA)B	tC(GCA)B	72 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tC(GCA)G	tC(GCA)G	72 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tC(GCA)P1	tC(GCA)P1	72 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tC(GCA)P2	tC(GCA)P2	72 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	GIC2	YDR309C	1152 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	FCF1	YDR339C	570 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YFR032C-B	YFR032C-B	264 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	ERJ5	YFR041C	888 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	AGE2	YIL044C	897 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YLR198C	YLR198C	360 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	PFK27	YOL136C	1194 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	RRP36	YOR287C	903 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	ZDS2	YML109W	2829 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	CET1	YPL228W	1650 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	IMH1	YLR309C	2736 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	STU1	YBL034C	4542 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	MIG3	YER028C	1185 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YGL006W-A	YGL006W-A	111 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YGR126W	YGR126W	693 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	PET130	YJL023C	1044 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	ANB1	YJR047C	474 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	RPC34	YNR003C	954 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	CPR8	YNR028W	927 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	ATG34	YOL083W	1239 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	RRP7	YCL031C	894 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	CTM1	YHR109W	1758 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	KAP95	YLR347C	2586 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	PEX1	YKL197C	3132 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	ASI1	YMR119W	1875 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	SPA2	YLL021W	4401 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	VID27	YNL212W	2349 nt		3.86	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	SEC59	YMR013C	1560 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	OAF3	YKR064W	2592 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	SYT1	YPR095C	3681 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YDR355C	YDR355C	303 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YGL177W	YGL177W	348 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	ALB1	YJL122W	528 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	RSM26	YJR101W	801 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	DDP1	YOR163W	567 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YPL088W	YPL088W	1029 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	ICS2	YBR157C	768 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YJR061W	YJR061W	2808 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	ULP1	YPL020C	1866 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	PGS1	YCL004W	1566 nt		3.85	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.84	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YGL041W-A	YGL041W-A	465 nt		3.84	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		3.84	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	AHP1	YLR109W	531 nt		3.84	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YML094C-A	YML094C-A	402 nt		3.84	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	PML39	YML107C	1005 nt		3.84	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	PNO1	YOR145C	825 nt		3.84	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	CIT1	YNR001C	1440 nt		3.84	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	STE6	YKL209C	3873 nt		3.84	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YKL050C	YKL050C	2769 nt		3.84	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	DAP2	YHR028C	2457 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	RAD55	YDR076W	1221 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YDR431W	YDR431W	312 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	IZH1	YDR492W	951 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	PRP18	YGR006W	756 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	BCD1	YHR040W	1101 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	MRP8	YKL142W	660 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	RPF2	YKR081C	1035 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	INN1	YNL152W	1230 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	DUG3	YNL191W	1074 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	SUR1	YPL057C	1149 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	NUP60	YAR002W	1620 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	BYE1	YKL005C	1785 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YPL109C	YPL109C	1974 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	PWP2	YCR057C	2772 nt		3.83	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	CUE3	YGL110C	1875 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	SMI1	YGR229C	1518 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	RPS18A	YDR450W	441 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	SPT4	YGR063C	309 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YIL156W-A	YIL156W-A	402 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YIR023C-A	YIR023C-A	324 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YAR070C	YAR070C	300 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YBR013C	YBR013C	390 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	TAF3	YPL011C	1062 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YPL168W	YPL168W	1293 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	MRPL27	YBR282W	441 nt		3.82	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	ACK1	YDL203C	1872 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	MDM10	YAL010C	1482 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	PRP22	YER013W	3438 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YGR117C	YGR117C	1431 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YGL138C	YGL138C	1038 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	ERV41	YML067C	1059 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YMR310C	YMR310C	954 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	FYV6	YNL133C	522 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YNL320W	YNL320W	855 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	SIL1	YOL031C	1266 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	FDH2	YPL275W	711 nt		3.81	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	MTR4	YJL050W	3222 nt		3.8	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.1 ms