Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF11Q05519 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms