Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms