Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms