Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XPCQ01831 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XPCQ01831 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XPCQ01831 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
XPCQ01831 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XPCQ01831 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XPCQ01831 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
XPCQ01831 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPCQ01831 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPCQ01831 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPCQ01831 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPCQ01831 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPCQ01831 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPCQ01831 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
XPCQ01831 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
XPCQ01831 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPCQ01831 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPCQ01831 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XPCQ01831 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XPCQ01831 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
XPCQ01831 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
XPCQ01831 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
XPCQ01831 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
XPCQ01831 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XPCQ01831 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XPCQ01831 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
XPCQ01831 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XPCQ01831 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms