Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELF3P78545 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELF3P78545 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELF3P78545 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELF3P78545 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELF3P78545 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELF3P78545 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ELF3P78545 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ELF3P78545 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELF3P78545 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ELF3P78545 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELF3P78545 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELF3P78545 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELF3P78545 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELF3P78545 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELF3P78545 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELF3P78545 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELF3P78545 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELF3P78545 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ELF3P78545 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ELF3P78545 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms