Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX4P78413 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX4P78413 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX4P78413 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX4P78413 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX4P78413 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX4P78413 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX4P78413 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX4P78413 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX4P78413 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX4P78413 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX4P78413 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX4P78413 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX4P78413 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX4P78413 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX4P78413 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX4P78413 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX4P78413 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX4P78413 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX4P78413 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX4P78413 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX4P78413 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX4P78413 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX4P78413 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX4P78413 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX4P78413 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX4P78413 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX4P78413 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX4P78413 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX4P78413 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX4P78413 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX4P78413 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX4P78413 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms