Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOMO3P69849 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms