Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBXN2AP68543 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms