Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms